More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1604 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  767    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  45.4 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  45.89 
 
 		 356 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  44.79 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05235  branched-chain amino acid aminotransferase  46.29 
 
 		 353 aa  330  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  42.69 
 
 		 354 aa  328  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  40.97 
 
 		 358 aa  322  8e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.95 
 
 		 357 aa  311  7.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0360453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 356 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  43.15 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  41.43 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  43.23 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  42.98 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  40.98 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  38.22 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  40.5 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  41.19 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4770  branched-chain amino acid aminotransferase  41.26 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  41.19 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.1 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  41.3 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  38.55 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 		 353 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  38.59 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  40.52 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  39.46 
 
 		 371 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  39.83 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  39.04 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  39.64 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.86 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  38.86 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  37.19 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  41.59 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  36.91 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  36.91 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  36.91 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  39.17 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  38.4 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  37.8 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  38.62 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  38.59 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.71 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  36.44 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  39.4 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  40.18 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  37.39 
 
 		 363 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  38.74 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  38 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  36.12 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  38.51 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  37.98 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  37.98 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  35.93 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  36.72 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  37.88 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  38.02 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  38.1 
 
 		 336 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  38.92 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  36.52 
 
 		 357 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  35.39 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  34.82 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0618  putative branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  38.35 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  35.41 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  36.83 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  38.62 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  36.5 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  36.5 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  38.44 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>