More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0289 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0340  branched-chain amino acid aminotransferase  84.25 
 
 		 363 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 363 aa  755    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3634  branched-chain amino acid aminotransferase  84.25 
 
 		 363 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0310  branched-chain amino acid aminotransferase  84.25 
 
 		 363 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0414  branched-chain amino acid aminotransferase  85.36 
 
 		 363 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  83.7 
 
 		 363 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  84.25 
 
 		 363 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  80.94 
 
 		 363 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4027  branched-chain amino acid aminotransferase  83.47 
 
 		 363 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4146  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4053  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  80.56 
 
 		 362 aa  624  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  80.66 
 
 		 363 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  79.22 
 
 		 363 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  79.44 
 
 		 361 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  45 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  43.02 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  42.94 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  44.51 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  43.82 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  43.27 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  42.22 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 		 356 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  43.22 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  43.22 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  41.78 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.18 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  43.79 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  42.99 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  42.98 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  40.93 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  41.21 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  41.98 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  41.21 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  43.66 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  39.73 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  41.71 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  42.73 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  41.19 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 377 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  39.89 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.95 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  41.34 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  39.89 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  39.44 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  43.2 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  41.78 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 		 365 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 		 365 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  38.83 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  40.82 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  38.95 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 367 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 374 aa  245  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  40.11 
 
 		 374 aa  245  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 362 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  41.42 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  40.61 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  39.72 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  37.61 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  39.17 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  39.72 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1168  branched-chain amino acid aminotransferase  43.58 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.882569  normal  0.0790533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  37.18 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  41.54 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  37.43 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>