More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1148 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  97.94 
 
 		 339 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 339 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  85.25 
 
 		 339 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  82.01 
 
 		 339 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  81.71 
 
 		 339 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  82.01 
 
 		 339 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  82.01 
 
 		 339 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  74.4 
 
 		 339 aa  545  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  73.59 
 
 		 339 aa  541  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  68.55 
 
 		 341 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  68.55 
 
 		 341 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  68.15 
 
 		 340 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  66.27 
 
 		 340 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  63.39 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  46.94 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  47.38 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 		 345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  44.64 
 
 		 409 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  42.73 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  42.81 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  41.37 
 
 		 367 aa  248  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32849  predicted protein  45.42 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  39.88 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 		 357 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  39.17 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  39.88 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  39.58 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 359 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.12 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 		 370 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  39.04 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  40.77 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  38.62 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  40.7 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  40.7 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  41.62 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  39.36 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  37.35 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  38.39 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  40.41 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  40.77 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  36.87 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00385  branched-chain amino-acid transaminase, putative (Eurofung)  35.94 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  39.12 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  38.51 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  39.17 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  39.16 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  39.7 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  39.7 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  39.76 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  38.35 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  37.2 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  36.61 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  36.58 
 
 		 353 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  41.07 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  36.58 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  37.35 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0414  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  35.24 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  36.58 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  35.4 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  36.5 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  36.28 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  37.39 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>