More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3511 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 339 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  99.71 
 
 		 339 aa  703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  98.23 
 
 		 339 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  99.12 
 
 		 339 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  85.84 
 
 		 339 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  81.71 
 
 		 339 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  81.42 
 
 		 339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  72.4 
 
 		 339 aa  519  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  69.14 
 
 		 339 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  68.66 
 
 		 341 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  68.66 
 
 		 341 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 		 340 aa  478  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 		 340 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  64.29 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  52.38 
 
 		 347 aa  352  8e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  46.8 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  48.21 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  44.64 
 
 		 409 aa  288  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  44.55 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32849  predicted protein  48.44 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  40.65 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  39.76 
 
 		 356 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  42.01 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  39.76 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  42.06 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  40.36 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  38.76 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  39.56 
 
 		 362 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  39.23 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 370 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  40.57 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  40.65 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  40.18 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  37.32 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.59 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.18 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  40.31 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  38.69 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 368 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 		 371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  38.53 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  40.65 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  37.61 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  40.77 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.3 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  39.06 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 		 374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  37.39 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  39.25 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  37.84 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  38.81 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  38.71 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  36.2 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  41.42 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.38 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  39.82 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  35.88 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  39.46 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  39.88 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  39.88 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  37.9 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  37.8 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  39.59 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  38.55 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>