More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1319 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
347 aa  712    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  73.98 
 
 
344 aa  530  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  61.01 
 
 
340 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 
340 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  58.88 
 
 
340 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 
339 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  55.33 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  55.33 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  54.17 
 
 
339 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  55.19 
 
 
339 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  54.76 
 
 
339 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  52.98 
 
 
339 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  52.98 
 
 
339 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  52.38 
 
 
339 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  52.68 
 
 
339 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  47.65 
 
 
348 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  46.63 
 
 
345 aa  297  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
345 aa  292  7e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  42.23 
 
 
409 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  41.47 
 
 
358 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
354 aa  248  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  39.94 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  41.59 
 
 
370 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  43.12 
 
 
366 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 
370 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  43.12 
 
 
366 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 
367 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  40.82 
 
 
357 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 
358 aa  236  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  40.37 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  41.27 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.06 
 
 
362 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  42.77 
 
 
356 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  42.63 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  41.43 
 
 
359 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
370 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 
358 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 
358 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
357 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  41.88 
 
 
373 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
367 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 
365 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 
367 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  39.82 
 
 
356 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
356 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  41.03 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 
367 aa  225  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  40.5 
 
 
367 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 
361 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  36.81 
 
 
357 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  40.49 
 
 
371 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  39.49 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  38.26 
 
 
364 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  38.75 
 
 
379 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  40.37 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 
368 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  40.3 
 
 
367 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  38.98 
 
 
371 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.58 
 
 
354 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  38.58 
 
 
354 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  38.32 
 
 
372 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  37.97 
 
 
359 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
363 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  41.5 
 
 
359 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  36.64 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  41.08 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  42.32 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  42.32 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  34.47 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  37.85 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  37.24 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  42.01 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  40.31 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  40.31 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  40.31 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 
370 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 
359 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  35.24 
 
 
358 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  36.73 
 
 
362 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  35.5 
 
 
362 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 
363 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
366 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  40.12 
 
 
366 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  36.28 
 
 
363 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
361 aa  209  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.44 
 
 
373 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 
368 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
374 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  39.63 
 
 
366 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  37.13 
 
 
356 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>