More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50793 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  100 
 
 		 409 aa  848    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  45.82 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  44.93 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  43.7 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  45.24 
 
 		 339 aa  303  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  44.64 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  45.56 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  45.56 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  44.16 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  44.57 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  44.64 
 
 		 339 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  44.35 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  44.35 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  44.28 
 
 		 339 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  44.97 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 		 340 aa  272  9e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00385  branched-chain amino-acid transaminase, putative (Eurofung)  39.94 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07876  branched-chain amino-acid transaminase, putative (Eurofung)  40.41 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 345 aa  247  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  39.53 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  41.48 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  33.69 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  35.8 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  36.57 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  36.44 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  36.92 
 
 		 371 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  36.91 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  36.1 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  36.91 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  35.8 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  36.34 
 
 		 367 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  35.96 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  37.02 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  36.31 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  35.24 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32849  predicted protein  41.09 
 
 		 299 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  36.59 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  35.63 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  32.57 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  33.63 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  33.14 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  33.14 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  35.38 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  32.89 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  34.3 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  33.62 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  31.38 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  33.24 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  33.43 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  34.12 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  32.94 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  34.49 
 
 		 359 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  34.86 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  34.71 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.43 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  34.66 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  32.66 
 
 		 361 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  33.52 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  32.18 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  32.79 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  34.47 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  34.5 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  35.06 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0618  putative branched-chain amino acid aminotransferase  33.04 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  34.33 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  34.12 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  33.71 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  34.01 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  32.08 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  33.63 
 
 		 354 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  33.15 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  33.24 
 
 		 370 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  32.55 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  32.55 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  34.97 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>