More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0603 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 877 aa  1805    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.54 
 
 		 836 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 808 aa  508  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 903 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 802 aa  501  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 892 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 908 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.81 
 
 		 886 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 885 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 901 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 855 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 863 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  32.31 
 
 		 925 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 855 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 864 aa  402  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 881 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.23 
 
 		 846 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 845 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 896 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.44 
 
 		 916 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 876 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  37.5 
 
 		 861 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 906 aa  365  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 860 aa  364  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 905 aa  364  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 928 aa  364  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 865 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.42 
 
 		 858 aa  354  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 862 aa  351  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 877 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 902 aa  348  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 871 aa  348  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 895 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 863 aa  346  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 894 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 873 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 911 aa  340  9e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 906 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 872 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 869 aa  333  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 886 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 886 aa  330  9e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 886 aa  327  9e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 886 aa  326  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 865 aa  324  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 858 aa  324  5e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 865 aa  317  8e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 808 aa  301  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 809 aa  301  5e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 799 aa  300  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 799 aa  298  3e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 799 aa  298  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 806 aa  294  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 799 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 881 aa  287  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 816 aa  283  8.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 884 aa  283  9e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 909 aa  282  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 947 aa  266  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 882 aa  266  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 947 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 892 aa  265  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 912 aa  264  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 865 aa  263  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.28 
 
 		 883 aa  262  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 865 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 771 aa  259  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  24.97 
 
 		 947 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 894 aa  259  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 922 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 977 aa  257  7e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2150  valyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 907 aa  257  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 904 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 		 954 aa  254  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 955 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 879 aa  252  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 926 aa  251  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 959 aa  251  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5529  valyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 895 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0965333 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09000  valyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 888 aa  249  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.521853  normal  0.529828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 902 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 882 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 908 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 908 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 958 aa  245  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 958 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0533  valyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 942 aa  244  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535322  normal  0.45531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 958 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 		 883 aa  243  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 958 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2855  valyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 921 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 958 aa  241  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 909 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 880 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 874 aa  237  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0291  valyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 890 aa  237  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72245  valyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 1051 aa  236  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6239  valyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 881 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 880 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>