More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5200 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 855 aa  872    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 877 aa  1149    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  70.19 
 
 		 881 aa  1216    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.11 
 
 		 916 aa  1106    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 860 aa  1109    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  56.11 
 
 		 925 aa  988    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 894 aa  1092    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 862 aa  1088    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  78.95 
 
 		 903 aa  1359    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  69.36 
 
 		 836 aa  1165    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.59 
 
 		 886 aa  1157    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  71.59 
 
 		 858 aa  1178    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  68.15 
 
 		 845 aa  1147    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  71.56 
 
 		 846 aa  1186    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 895 aa  1075    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 902 aa  1103    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 876 aa  1764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 901 aa  1082    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 911 aa  1018    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 873 aa  1082    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 885 aa  1053    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 872 aa  1078    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  68.71 
 
 		 861 aa  1189    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 		 871 aa  1042    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 906 aa  1125    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 864 aa  596  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 802 aa  590  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 808 aa  585  1e-166  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 896 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 908 aa  537  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 928 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 892 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 905 aa  524  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 865 aa  463  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 855 aa  463  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 869 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 864 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 906 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 858 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 886 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 886 aa  439  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 863 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 886 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 877 aa  388  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 799 aa  385  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 799 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 771 aa  382  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 806 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 816 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 808 aa  349  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 903 aa  317  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 903 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 882 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 893 aa  310  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 881 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 881 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 885 aa  307  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 881 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 882 aa  303  6.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  303  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 892 aa  300  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 881 aa  299  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 882 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 861 aa  297  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1477  valyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 1052 aa  297  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516539  normal  0.491266 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 883 aa  296  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 880 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 912 aa  293  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 883 aa  293  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 909 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0932  valyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 931 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.919072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 880 aa  293  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 891 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 905 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 877 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 882 aa  290  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 881 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 872 aa  289  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 909 aa  289  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 879 aa  289  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 881 aa  289  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 876 aa  289  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 881 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 926 aa  289  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 904 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>