More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0307 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 906 aa  882    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 894 aa  850    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  48.4 
 
 		 925 aa  806    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 881 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  54.63 
 
 		 886 aa  882    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 901 aa  855    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 902 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 872 aa  816    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 903 aa  856    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 895 aa  839    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 862 aa  898    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  57.33 
 
 		 836 aa  917    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  53.99 
 
 		 858 aa  875    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  56.63 
 
 		 846 aa  910    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  52.84 
 
 		 861 aa  866    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 873 aa  814    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 876 aa  875    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 845 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 871 aa  827    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 911 aa  827    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 877 aa  857    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  53.6 
 
 		 916 aa  872    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 885 aa  816    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 860 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 855 aa  1708    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 808 aa  591  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 864 aa  588  1e-166  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 802 aa  588  1e-166  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 896 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 928 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 908 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 905 aa  489  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 863 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 892 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 864 aa  458  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 886 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 855 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 865 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 886 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 886 aa  446  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 863 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 906 aa  439  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 869 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 858 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 886 aa  435  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 809 aa  432  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 		 877 aa  426  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 799 aa  419  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 865 aa  422  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 816 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 799 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 808 aa  407  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 799 aa  399  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 771 aa  379  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 806 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 909 aa  317  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 911 aa  317  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 881 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 881 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 1002 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 881 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2239  valyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 868 aa  308  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659246  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 883 aa  305  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 882 aa  303  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 882 aa  302  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 879 aa  301  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 883 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 881 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 909 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 881 aa  298  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 1006 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 880 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 883 aa  294  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 909 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 880 aa  293  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 909 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 879 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 		 885 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 883 aa  288  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 909 aa  287  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  287  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  287  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  287  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  287  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 881 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 881 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 883 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 903 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 880 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 876 aa  284  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 904 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 876 aa  283  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 876 aa  283  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>