More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2881 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 911 aa  1035    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 902 aa  1065    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 901 aa  1100    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  81.47 
 
 		 881 aa  1457    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.21 
 
 		 886 aa  1157    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 894 aa  1069    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 885 aa  1036    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  69.85 
 
 		 836 aa  1181    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  71.65 
 
 		 846 aa  1207    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 862 aa  1085    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 860 aa  1113    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 872 aa  1032    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 903 aa  1124    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 855 aa  882    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  69.06 
 
 		 845 aa  1169    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 		 858 aa  1749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 895 aa  1037    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  65.85 
 
 		 861 aa  1127    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 906 aa  1129    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  69.65 
 
 		 876 aa  1184    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 873 aa  1035    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 		 877 aa  1146    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 		 871 aa  1075    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.33 
 
 		 916 aa  1107    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  57.11 
 
 		 925 aa  998    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 808 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 802 aa  592  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 864 aa  581  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 896 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 905 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 908 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 892 aa  498  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 865 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 864 aa  466  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 863 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 869 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 886 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 886 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 886 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 855 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 863 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 906 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 865 aa  439  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 886 aa  436  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 809 aa  421  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 771 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 816 aa  365  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 877 aa  352  1e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 808 aa  346  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 911 aa  297  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 882 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 926 aa  294  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 903 aa  290  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 885 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 912 aa  288  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 1006 aa  287  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 880 aa  287  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 881 aa  286  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 879 aa  286  9e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 903 aa  286  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 1002 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 904 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 930 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 909 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 882 aa  283  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 865 aa  283  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 906 aa  282  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 865 aa  282  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 906 aa  282  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 881 aa  281  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 893 aa  281  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 947 aa  280  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 881 aa  280  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 952 aa  280  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 905 aa  280  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 954 aa  279  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 883 aa  278  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 909 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 909 aa  278  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 881 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 881 aa  277  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 952 aa  277  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 881 aa  277  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 881 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 881 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 968 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>