More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1497 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 806 aa  1001    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  85.91 
 
 		 799 aa  1413    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  85.98 
 
 		 799 aa  1433    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 799 aa  1639    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  85.98 
 
 		 799 aa  1437    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 771 aa  593  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 858 aa  511  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 865 aa  489  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 855 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 864 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 809 aa  484  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 886 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 886 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 886 aa  479  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 863 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 906 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 869 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 886 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 865 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 816 aa  449  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 802 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 808 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 865 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 808 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 896 aa  425  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 908 aa  426  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 881 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.56 
 
 		 846 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.9 
 
 		 836 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 905 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 845 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 892 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.93 
 
 		 886 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 928 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 864 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  32.86 
 
 		 861 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 860 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 876 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 855 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.37 
 
 		 916 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.37 
 
 		 858 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 877 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 906 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 885 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 902 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 894 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 901 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 882 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 873 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 881 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 895 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 862 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 865 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 865 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 879 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 891 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 884 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 881 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 874 aa  357  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 872 aa  354  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 883 aa  354  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 880 aa  353  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 881 aa  353  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 903 aa  353  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 881 aa  353  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 885 aa  349  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 880 aa  345  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 880 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 911 aa  344  4e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 882 aa  343  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  31.82 
 
 		 925 aa  342  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 879 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 892 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 882 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 883 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 867 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 881 aa  334  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 892 aa  333  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 887 aa  331  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 897 aa  330  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 904 aa  328  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 866 aa  327  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 886 aa  327  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 861 aa  326  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 886 aa  326  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 884 aa  326  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 885 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 887 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 891 aa  324  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 871 aa  324  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 879 aa  323  9.000000000000001e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 884 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 886 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 872 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 888 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 888 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>