More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3473 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 881 aa  1139    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 895 aa  998    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 876 aa  1086    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 902 aa  1070    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.34 
 
 		 836 aa  1100    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 877 aa  1075    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  63.5 
 
 		 858 aa  1104    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 		 862 aa  1040    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 901 aa  1061    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 		 906 aa  1094    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 903 aa  1029    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 845 aa  1097    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.53 
 
 		 886 aa  1131    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  56.73 
 
 		 925 aa  1000    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  62.37 
 
 		 861 aa  1099    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.74 
 
 		 846 aa  1112    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  63.09 
 
 		 916 aa  1091    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 873 aa  1034    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 911 aa  1019    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 871 aa  1778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 872 aa  1027    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 860 aa  1060    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 885 aa  1035    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 855 aa  849    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 894 aa  1063    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 802 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 808 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 864 aa  569  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 896 aa  514  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 928 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 892 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 908 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 886 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 886 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 886 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 863 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 906 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 864 aa  429  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 863 aa  429  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 855 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 858 aa  419  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 865 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 809 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 865 aa  406  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 869 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 865 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 816 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 808 aa  364  4e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 771 aa  361  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 877 aa  349  1e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 799 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 806 aa  344  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 799 aa  340  9.999999999999999e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 799 aa  337  7.999999999999999e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 881 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 881 aa  295  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 881 aa  295  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 882 aa  291  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 881 aa  291  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 881 aa  291  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 881 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 885 aa  290  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 893 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 911 aa  287  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 879 aa  286  9e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 880 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.28 
 
 		 883 aa  284  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 903 aa  283  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 909 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 880 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 894 aa  282  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 1006 aa  280  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 883 aa  280  9e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1070  valyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 1242 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147885  hitchhiker  0.000000182649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 912 aa  278  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 865 aa  278  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 909 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 881 aa  277  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 881 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 865 aa  277  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 1002 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 883 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 909 aa  276  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 909 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 903 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 882 aa  274  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 874 aa  273  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 880 aa  273  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 880 aa  271  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 883 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 882 aa  270  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>