More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1197 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  79.78 
 
 		 925 aa  1503    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 894 aa  998    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 855 aa  806    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  59 
 
 		 846 aa  1004    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 901 aa  1149    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.63 
 
 		 916 aa  1194    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 881 aa  1028    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 872 aa  974    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 845 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 877 aa  1013    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 906 aa  1158    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  56.4 
 
 		 861 aa  981    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 911 aa  1882    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 860 aa  971    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 903 aa  964    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  58.92 
 
 		 858 aa  1008    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.51 
 
 		 886 aa  1156    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 895 aa  993    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 862 aa  939    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  58.49 
 
 		 836 aa  984    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 902 aa  1091    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 		 885 aa  1022    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 873 aa  975    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 871 aa  972    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 876 aa  1003    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 802 aa  587  1e-166  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 808 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 864 aa  555  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 896 aa  490  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 928 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 908 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 905 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 865 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 892 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 863 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 		 863 aa  427  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 855 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 865 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 886 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 864 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 886 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 865 aa  413  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 886 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 858 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 886 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 809 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 816 aa  361  4e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 808 aa  346  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 799 aa  344  4e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 799 aa  344  5e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 799 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 799 aa  335  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 806 aa  333  6e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 877 aa  324  5e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 771 aa  323  8e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 882 aa  290  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 904 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 882 aa  274  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 882 aa  273  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 881 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 909 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 911 aa  269  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 947 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 865 aa  265  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 880 aa  265  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 872 aa  264  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 865 aa  264  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 879 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 968 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 972 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 893 aa  263  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 926 aa  263  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 881 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 880 aa  262  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 881 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 957 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 1002 aa  261  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 954 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 881 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2241  valyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 910 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 930 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 883 aa  260  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 881 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 881 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 881 aa  259  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 881 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 881 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 881 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 947 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 879 aa  259  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 897 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 885 aa  258  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 881 aa  258  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 881 aa  258  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 882 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 912 aa  257  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 880 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 880 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>