More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1403 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  66.15 
 
 		 845 aa  1085    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 872 aa  1089    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  63.5 
 
 		 861 aa  1102    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 895 aa  1103    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 877 aa  1133    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 881 aa  1172    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 894 aa  1102    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  75.58 
 
 		 901 aa  1291    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  74.35 
 
 		 902 aa  1288    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 885 aa  1131    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 855 aa  874    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  64.21 
 
 		 903 aa  1102    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  76.85 
 
 		 906 aa  1392    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 		 886 aa  1791    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  64.04 
 
 		 925 aa  1128    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 		 862 aa  1046    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  68.74 
 
 		 846 aa  1159    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  68.57 
 
 		 836 aa  1105    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  68.98 
 
 		 858 aa  1139    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 873 aa  1095    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 871 aa  1078    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  74.37 
 
 		 916 aa  1315    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  66.36 
 
 		 876 aa  1155    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 911 aa  1164    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 860 aa  1070    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 864 aa  589  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 808 aa  582  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 928 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 908 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 905 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 892 aa  492  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 863 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 865 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 863 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 864 aa  452  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 877 aa  443  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 855 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 865 aa  439  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 865 aa  433  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 886 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 886 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 869 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 858 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 906 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 886 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 809 aa  404  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 799 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 799 aa  388  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 799 aa  389  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 799 aa  385  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 806 aa  371  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 771 aa  369  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 816 aa  361  4e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 881 aa  295  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 885 aa  294  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 881 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 881 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 881 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 881 aa  293  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 893 aa  293  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 882 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 881 aa  292  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 877 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 881 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 1002 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 909 aa  290  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 952 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 881 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 881 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 881 aa  289  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 872 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 900 aa  287  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 882 aa  287  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 861 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 954 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 882 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 911 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 876 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 880 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 957 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 955 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 888 aa  282  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 894 aa  280  7e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 882 aa  280  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 874 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 909 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 1006 aa  279  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 897 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 947 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 880 aa  277  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 883 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 903 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>