More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3508 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 911 aa  1030    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  66.63 
 
 		 861 aa  1127    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  69.44 
 
 		 858 aa  1141    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 881 aa  1185    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 862 aa  1039    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.55 
 
 		 836 aa  1098    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 860 aa  1060    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 894 aa  1127    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 906 aa  1127    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 903 aa  1132    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 845 aa  1102    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 855 aa  848    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.96 
 
 		 916 aa  1118    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 901 aa  1071    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 885 aa  1043    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 877 aa  1770    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 895 aa  1072    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 		 872 aa  1083    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.28 
 
 		 846 aa  1108    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 876 aa  1157    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  65.01 
 
 		 902 aa  1106    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 873 aa  1090    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.02 
 
 		 886 aa  1144    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 871 aa  1049    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  59.14 
 
 		 925 aa  1015    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 864 aa  587  1e-166  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 808 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 928 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 908 aa  513  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 892 aa  512  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 905 aa  492  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 864 aa  465  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 865 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 863 aa  452  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 886 aa  446  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 855 aa  446  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 886 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 906 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 869 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 865 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 886 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 865 aa  430  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 858 aa  427  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 863 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 799 aa  386  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 808 aa  379  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 816 aa  362  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 877 aa  348  3e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 955 aa  307  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 893 aa  306  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 952 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 911 aa  303  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 883 aa  301  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 883 aa  299  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 909 aa  299  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 903 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 957 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 972 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 905 aa  299  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 882 aa  296  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 954 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 885 aa  296  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 881 aa  295  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 968 aa  295  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 909 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 930 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 903 aa  291  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 880 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 881 aa  290  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 947 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 952 aa  289  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 1002 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 902 aa  288  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 904 aa  287  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 1006 aa  286  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 926 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 881 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 908 aa  284  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 908 aa  284  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 880 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 896 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 881 aa  283  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 881 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 881 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 881 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 947 aa  282  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>