More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5529 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 951 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 951 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 880 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 887 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 948 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 876 aa  1023    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 909 aa  654    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 876 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 921 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 908 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 881 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 973 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 883 aa  736    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 865 aa  672    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 958 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 948 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 881 aa  747    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 881 aa  746    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 879 aa  721    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 881 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 877 aa  1046    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 921 aa  661    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 921 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 948 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 984 aa  656    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 943 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 904 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 976 aa  654    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 896 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 959 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 1002 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 943 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 929 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 948 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 885 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 955 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 901 aa  748    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 925 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 902 aa  761    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 914 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 887 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 883 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 924 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 881 aa  747    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 918 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 909 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 884 aa  736    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 879 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 880 aa  713    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 884 aa  737    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 918 aa  661    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2085  valyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 953 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000735472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 886 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 917 aa  701    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 922 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 952 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 943 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 958 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 918 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 968 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 968 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 947 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 1006 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 984 aa  657    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 955 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 958 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 963 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 951 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 884 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 876 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 908 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 921 aa  675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 926 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 880 aa  1124    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 880 aa  703    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 880 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 948 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 911 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 958 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 958 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 917 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 968 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 883 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 893 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 947 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 950 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 880 aa  715    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 902 aa  704    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 879 aa  668    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 894 aa  679    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 883 aa  725    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1015  valyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 948 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 892 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 929 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 958 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 880 aa  662    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 886 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 904 aa  757    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 953 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 952 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>