More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2435 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 947 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 880 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 887 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 896 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 876 aa  1070    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 909 aa  665    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 876 aa  687    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 921 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 886 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 881 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 955 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 883 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1279  valyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 950 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 958 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 941 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 881 aa  746    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 881 aa  746    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 881 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 955 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 921 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 921 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 955 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 880 aa  641    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 943 aa  680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 963 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 912 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 952 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 1002 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 955 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 929 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 955 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 885 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3121  valyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 958 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000565477  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 901 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 925 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 902 aa  757    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 914 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 887 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 883 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 924 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 881 aa  746    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 955 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 918 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 909 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 926 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 865 aa  730    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 879 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 880 aa  680    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 955 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 1006 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 972 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 884 aa  750    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 922 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 952 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 943 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 955 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 959 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 968 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 968 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 866 aa  681    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 954 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 955 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 884 aa  694    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 929 aa  666    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 904 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 872 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 917 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 877 aa  1088    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 881 aa  744    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 926 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 880 aa  1820    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 880 aa  720    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 880 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 948 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 911 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 958 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 958 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 917 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 968 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 883 aa  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 893 aa  663    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 958 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 950 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 880 aa  709    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 902 aa  692    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 879 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 894 aa  688    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 883 aa  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 943 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 892 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 929 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 958 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 888 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 879 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 886 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 904 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 953 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 918 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>