More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0291 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 955 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1992  valyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 963 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019094 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 880 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 887 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 948 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 876 aa  746    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 909 aa  689    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 876 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 921 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 968 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 881 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 973 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 883 aa  677    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 884 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 958 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 947 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  720    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 881 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 955 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 921 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 921 aa  663    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 948 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 976 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 943 aa  681    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 933 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 955 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 912 aa  712    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 952 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 1002 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 955 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 929 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 948 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 885 aa  727    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 955 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 901 aa  760    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 925 aa  685    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 902 aa  763    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 914 aa  681    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 887 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 883 aa  742    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 924 aa  705    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 881 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 918 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 909 aa  708    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 926 aa  710    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 879 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 880 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 955 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 918 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 933 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 918 aa  653    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 922 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 952 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 943 aa  711    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 973 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 959 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 958 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 955 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 947 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 954 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 1006 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 955 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 929 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1951  valyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 925 aa  687    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 955 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 883 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 917 aa  712    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 921 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 926 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 880 aa  718    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 880 aa  679    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 880 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 948 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 911 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 958 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 958 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 917 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 908 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 883 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 893 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 955 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 941 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 880 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 902 aa  636    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 879 aa  682    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 894 aa  680    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 883 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 955 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 892 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 929 aa  700    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 958 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 888 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 886 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 904 aa  756    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 953 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 883 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 952 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 897 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 908 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>