More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3958 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3958  ferredoxin  100 
 
 		 317 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2623  ferredoxin  77.93 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  56.65 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  49.04 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  40.12 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  38.49 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  36.5 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.34 
 
 		 321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  35 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  35 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  35.09 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.69 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  34.38 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.69 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.06 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.94 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  36.02 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  34.89 
 
 		 788 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  37.74 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.69 
 
 		 780 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  35.71 
 
 		 784 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  35.85 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.62 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  33.54 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  37.81 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  36.34 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  34.78 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.83 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  39.2 
 
 		 784 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  38.87 
 
 		 784 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.63 
 
 		 783 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  39.12 
 
 		 783 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  33.64 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.38 
 
 		 775 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.09 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.09 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  32.5 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.83 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  34.19 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  32.5 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.89 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  34.89 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  34.89 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  34.08 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  32.5 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  33.44 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  35.4 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.15 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  35.09 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.96 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  34.65 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  34.78 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  36.89 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  35.69 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  35.62 
 
 		 794 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  35.56 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  35.4 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  34.27 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.71 
 
 		 774 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  36.04 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.47 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  33.75 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  32.19 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  34.55 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  34.16 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  34.16 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  36.65 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  35.71 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  33.02 
 
 		 782 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  36.09 
 
 		 788 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  33.23 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  33.43 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  34.15 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.56 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  31.55 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  36.25 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  35.15 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  34.56 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.05 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  32.41 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  31.86 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  31.55 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  34.09 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  35.09 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  33.22 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  36.93 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  35.37 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  31.4 
 
 		 558 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  31.89 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  37.15 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  32.02 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>