More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4832 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  100 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  60.84 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  45.37 
 
 		 783 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  41.56 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  44.73 
 
 		 784 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  44.73 
 
 		 784 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  44.73 
 
 		 784 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  44.73 
 
 		 784 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  45.05 
 
 		 784 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  44.73 
 
 		 784 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  44.73 
 
 		 784 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.66 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.21 
 
 		 784 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  42.66 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  42.66 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  41.96 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  38.23 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  37.9 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  41.61 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  36.31 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  36.31 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  41.38 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.07 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.96 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.61 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  41.43 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  40.32 
 
 		 780 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.88 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  42.14 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  40.25 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  41.08 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  37.9 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  40.63 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.6 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  40.71 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  40.58 
 
 		 769 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  37.14 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  41.07 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  38.29 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  39.45 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.12 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  37.72 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  37.72 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.74 
 
 		 783 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  34.92 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.48 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  37.3 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  35.33 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  39.74 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  42.56 
 
 		 794 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  41.96 
 
 		 775 aa  188  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  40.44 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.45 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  39 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.75 
 
 		 782 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  35.6 
 
 		 788 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  41.79 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.04 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  34.47 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  38.97 
 
 		 788 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  37.2 
 
 		 588 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  40 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  36.71 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  37.18 
 
 		 1069 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  37.58 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  43.54 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  39.81 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4112  oxidoreductase/oxygenase, vanB family  38.1 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  39.13 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.26 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  38.13 
 
 		 1070 aa  178  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  43.2 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  34.28 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  40.91 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.81 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  33.96 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  38.36 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  33.96 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  33.96 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.49 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  35.13 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.96 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  41.16 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.96 
 
 		 321 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.92 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  36.36 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.51 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  40 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  39.18 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  36.08 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  39.18 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  39.3 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.65 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  40 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  38.97 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  35.87 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  38.59 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  38.78 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>