112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0490 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0490  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 355 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  28.2 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  28.27 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.92 
 
 		 438 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.92 
 
 		 340 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  30.37 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  30.37 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.26 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  27.23 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  31.58 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  25.57 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  30.88 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.02 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.22 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  23.05 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.79 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.79 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.98 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.21 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.72 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  26.58 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.56 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  24.71 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  23.47 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  22.55 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  22.79 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.85 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.66 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.51 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.5 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  23.26 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  23.71 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  24.79 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0844  ABC transporter substrate-binding protein  25.97 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.89 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  24.46 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  29.11 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0465  NMT1/THI5 like domain protein  28.08 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0409028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.98 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  25.71 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  24.54 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.09 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.84 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  26.32 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  25.95 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.31 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  27.51 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  28.07 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.45 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.45 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  29.93 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  27.67 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.84 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.66 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.86 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.72 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  25.44 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.31 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  29.19 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  27.52 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.01 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25.93 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  29.61 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  21.76 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  25.83 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.83 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  27.89 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  22.71 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.85 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>