More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0926 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0926  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  36.78 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34580  predicted transcriptional regulator  38.3 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00510828  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  37 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  31.18 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  43.37 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  40.85 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  37.21 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.48 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.06 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  34.57 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  31.31 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  39.73 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  34.52 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  32.94 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  37.93 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  39.19 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.2 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  44.78 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  33.02 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  38.2 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.37 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  38.2 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.37 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  38.2 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.2 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.2 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  38.46 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  24 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>