More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34580  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00510828  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  65.25 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0371  transcriptional regulator, HxlR family  60.48 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  54.24 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 136 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  52.43 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  49.09 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  43.33 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.63 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.66 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  43.69 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.98 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.59 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  45.71 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  40.17 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  39.34 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  39.64 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  41.48 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.66 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.69 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  44.66 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  43.69 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.79 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  37.17 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.99 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  39.81 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  36.89 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  38.24 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  41.12 
 
 		 272 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  35.83 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  43.68 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>