More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0371 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0371  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 155 aa  308  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  69.84 
 
 		 127 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34580  predicted transcriptional regulator  60.48 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00510828  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  51.3 
 
 		 134 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  50.96 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  45 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  46.4 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  41.22 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.45 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  47.62 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  48.08 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.24 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  45.63 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  41.13 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 125 aa  94.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  94.4  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  43.7 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  45.1 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 134 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.06 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.45 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  42.31 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  43.93 
 
 		 272 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  39.81 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 135 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  40.87 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  46.08 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  36.7 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>