More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2910 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 410 aa  840    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  79.05 
 
 		 412 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  72.02 
 
 		 410 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.69 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  61 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  59.55 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  59.06 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 427 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  59.49 
 
 		 411 aa  484  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.04 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.45 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 423 aa  474  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 437 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.6 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.43 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  62.34 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  56.33 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 420 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.74 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.58 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  54.84 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 422 aa  461  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  55.95 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  58.79 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0615  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>