More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0615 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0615  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  848    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.46 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  57.39 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.89 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.89 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  54.93 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  53 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  54.2 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  53.73 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  53.14 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  52.51 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  54.92 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  53.25 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  55.01 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  53.25 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  55.05 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  52.77 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  53.37 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  52.52 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  51.32 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  51.9 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  53.61 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  52.07 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  51.89 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  52.16 
 
 		 413 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  52.77 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  52.91 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  53.03 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  53 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  52.05 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  51.57 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  53.73 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  52.05 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  53.66 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  52.43 
 
 		 440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.46 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  51.89 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>