More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0674 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0674  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19247  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1645  protein of unknown function DUF28  80.82 
 
 
245 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2194  hypothetical protein  58.4 
 
 
244 aa  292  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00428385  normal  0.442442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.42 
 
 
247 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  50.21 
 
 
252 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  47.92 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  48.12 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  47.3 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  48.33 
 
 
242 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  46.15 
 
 
246 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  48.77 
 
 
253 aa  229  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.21 
 
 
248 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  47.13 
 
 
253 aa  228  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  46.69 
 
 
248 aa  228  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  47.08 
 
 
247 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  46.47 
 
 
247 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.74 
 
 
249 aa  227  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.38 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.96 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  47.48 
 
 
248 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.55 
 
 
248 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  46.06 
 
 
247 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  46.72 
 
 
253 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  47.97 
 
 
250 aa  225  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  50.41 
 
 
252 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  47.35 
 
 
247 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  46.69 
 
 
246 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  45.9 
 
 
250 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  43.03 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.16 
 
 
248 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  46.47 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  46.06 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.13 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  45.42 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.55 
 
 
250 aa  219  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  46.18 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  46.69 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  45.23 
 
 
249 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  47.72 
 
 
250 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  46.09 
 
 
248 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  46.09 
 
 
248 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  46.09 
 
 
248 aa  218  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  44.44 
 
 
249 aa  218  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  45.9 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  49.38 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.9 
 
 
248 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  48.97 
 
 
248 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  48.97 
 
 
248 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  45.64 
 
 
250 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  45.83 
 
 
242 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  44.81 
 
 
246 aa  215  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  45.68 
 
 
248 aa  215  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  45.42 
 
 
240 aa  215  5e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.64 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  48.15 
 
 
243 aa  214  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.22 
 
 
248 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  46.86 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  48.12 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  45.38 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  44.96 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  44.81 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  46.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  46.22 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  45.16 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  46.84 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  47.54 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  47.79 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  47.54 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  47.3 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  47.93 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  45.99 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  48.1 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  45.8 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  45.61 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  42.63 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  45.57 
 
 
246 aa  211  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  45.57 
 
 
246 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  45.57 
 
 
246 aa  211  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  46.89 
 
 
247 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  46.41 
 
 
246 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  46.41 
 
 
246 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  46.91 
 
 
248 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  46.41 
 
 
246 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  46.22 
 
 
248 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  46.41 
 
 
246 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  47.06 
 
 
247 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  47.06 
 
 
247 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  46.15 
 
 
255 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  50.42 
 
 
242 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  45.87 
 
 
240 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  46.91 
 
 
248 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  45.23 
 
 
248 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>