More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2194 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2194  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00428385  normal  0.442442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1645  protein of unknown function DUF28  59.24 
 
 
245 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0674  hypothetical protein  58.4 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19247  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  52.26 
 
 
250 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  52.26 
 
 
250 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.15 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.15 
 
 
247 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  48.37 
 
 
247 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  47.74 
 
 
247 aa  238  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51.03 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.33 
 
 
247 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  235  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.01 
 
 
250 aa  234  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.39 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  51.01 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  51.45 
 
 
239 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  51.45 
 
 
239 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  52.23 
 
 
247 aa  231  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.76 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.42 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  48.16 
 
 
246 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  49.59 
 
 
247 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  50.2 
 
 
243 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  47.15 
 
 
247 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  50 
 
 
252 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  48.96 
 
 
239 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  50 
 
 
250 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  46.28 
 
 
246 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  47.77 
 
 
246 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  45.75 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.15 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  45.9 
 
 
250 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.34 
 
 
250 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  44.49 
 
 
243 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  46.75 
 
 
247 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  45.34 
 
 
251 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  47.77 
 
 
248 aa  222  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  50.41 
 
 
250 aa  221  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  47.37 
 
 
251 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  49.38 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  46.56 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  46.96 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  46.96 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  46.96 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  47.9 
 
 
248 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  46.12 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  47.33 
 
 
241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  46.99 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  44.13 
 
 
249 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.94 
 
 
249 aa  218  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.58 
 
 
251 aa  218  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  44.53 
 
 
252 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  45.93 
 
 
246 aa  218  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  47.56 
 
 
250 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  43.72 
 
 
249 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.87 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.41 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.12 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  43.72 
 
 
251 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  46.96 
 
 
248 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  47.95 
 
 
248 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  43.67 
 
 
250 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  48.12 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  44.08 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  45.49 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  44.18 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  46.34 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  46.96 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.13 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  47.76 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.96 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.94 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  46.94 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  43.15 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  48.95 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  45.08 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  45.71 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  45.71 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  48.4 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  45.71 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.97 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.56 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  46.56 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  46.56 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  44.53 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  46.56 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.56 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>