More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2709 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2709  DnaB domain protein helicase domain protein  100 
 
 		 472 aa  965    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  29.96 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  28.81 
 
 		 495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  28.84 
 
 		 498 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  30.06 
 
 		 498 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  29.88 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  29.85 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  28.78 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  30.1 
 
 		 497 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  29.17 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  30 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  31.09 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  30.15 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  30.88 
 
 		 496 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  30.88 
 
 		 496 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  29.5 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  30.04 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  29.96 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  29.18 
 
 		 496 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  29.96 
 
 		 493 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  28.72 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  29.54 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  29.44 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  29.56 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  30 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  27.9 
 
 		 495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  29.57 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  29.56 
 
 		 498 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  27.9 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  29.26 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  27.9 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  28.6 
 
 		 501 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  27.84 
 
 		 500 aa  180  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  27.8 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  28.88 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  28.14 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  28.48 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  28.48 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  30.25 
 
 		 501 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  30.45 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  30.45 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  27.66 
 
 		 460 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  28.17 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  28.29 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  29.63 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  28.12 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  27.66 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  27.92 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  29.69 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  28.19 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  28.45 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  28.86 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  28.39 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  28.17 
 
 		 481 aa  163  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  27.8 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  28.69 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  27.98 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  29.09 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  28.57 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  29.59 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  29.11 
 
 		 494 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  27.66 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  29.88 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  28.6 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  27.87 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  29.83 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  26.6 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  27.65 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  29.59 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  28.84 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  28.21 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  27.76 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  27.75 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  26.97 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  27.16 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  27.8 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  27.04 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  27.85 
 
 		 488 aa  156  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  27.99 
 
 		 472 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  27.66 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  29 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  29 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  27.1 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  28.09 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  28.09 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  29.07 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  27.68 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  27.72 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  26.2 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  27.81 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>