More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1457 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
254 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
248 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
253 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
245 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
252 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  38.31 
 
 
248 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  39.75 
 
 
245 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
248 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  39.92 
 
 
248 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
249 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  39.92 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
247 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  37.3 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  37.6 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
253 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  37.4 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.37 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
247 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  39.27 
 
 
248 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
250 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
248 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  37.2 
 
 
247 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 
248 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
248 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
249 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  40.62 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
248 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
248 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  38.04 
 
 
253 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 
248 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
250 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
249 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
261 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
242 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
245 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
254 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  37.55 
 
 
253 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  37.55 
 
 
253 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
252 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
276 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
246 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  35.89 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
247 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
249 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.34 
 
 
265 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
269 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  37.8 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
248 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
253 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  36.76 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.1 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.66 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.27 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  37.8 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>