More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1521 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.86 
 
 
256 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.22 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 
256 aa  332  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  0.247355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0924  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  46.3 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171605  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
259 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
263 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
285 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
258 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
255 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  37.6 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
287 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
257 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
248 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.38 
 
 
266 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.08 
 
 
246 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
297 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.13 
 
 
307 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
285 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
285 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
306 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
265 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
270 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
284 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
255 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
272 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
269 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
300 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
288 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
277 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
286 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
290 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
292 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
290 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
290 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
247 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
269 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
284 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
285 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.74 
 
 
297 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
280 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
261 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
285 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
293 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.98 
 
 
261 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.98 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.01 
 
 
306 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.47 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.47 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.69 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.21 
 
 
250 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
285 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
308 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.13 
 
 
246 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
288 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
257 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0443  glucose 1-dehydrogenase  36.72 
 
 
266 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.43 
 
 
247 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
261 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
298 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
248 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
288 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.69 
 
 
246 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0440497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
285 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
287 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
250 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
257 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
260 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.71 
 
 
286 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
247 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.29 
 
 
250 aa  148  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>