More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4761 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  0.247355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.17 
 
 
256 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.67 
 
 
256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 
261 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
259 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
259 aa  254  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0924  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  49.21 
 
 
260 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171605  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
263 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
258 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
265 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
257 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
270 aa  192  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
255 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  38.78 
 
 
268 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  39.31 
 
 
266 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  38.96 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
269 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
291 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
261 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  41.6 
 
 
261 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2405  acetoin dehydrogenase  39.43 
 
 
260 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2360  acetoin dehydrogenase  39.43 
 
 
253 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2316  acetoin dehydrogenase  39.43 
 
 
260 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2517  acetoin dehydrogenase  39.43 
 
 
260 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
300 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
251 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02067  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.8 
 
 
253 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
253 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
257 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02025  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  37.35 
 
 
269 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
253 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2409  acetoin dehydrogenase  39.02 
 
 
260 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  37.6 
 
 
261 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0834  acetoin dehydrogenase  37.8 
 
 
253 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  37.6 
 
 
261 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  37.4 
 
 
253 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0298905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
269 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.76 
 
 
261 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2427  acetoin dehydrogenase  37.8 
 
 
253 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.43 
 
 
246 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
285 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
261 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
285 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
285 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
247 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
284 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
285 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.89 
 
 
247 aa  165  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2272  acetoin dehydrogenase  37.4 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1510  acetoin dehydrogenase  37.4 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  36.8 
 
 
261 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  36.8 
 
 
261 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0906  acetoin dehydrogenase  37.4 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  36.8 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  36.14 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  36.8 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.28571  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
262 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  36.55 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  36.4 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
277 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
289 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0867  acetoin dehydrogenase  40.91 
 
 
279 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
250 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.06 
 
 
286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
317 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
282 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
255 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
288 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
268 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
246 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
288 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
272 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
268 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
290 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
285 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.76 
 
 
250 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
292 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
290 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
290 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>