More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0698 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0698  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 
338 aa  693    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0170048  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2933  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  75.15 
 
 
338 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.735416  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3620  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  56.3 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3806  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  43.98 
 
 
339 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2485  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.83 
 
 
360 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0992841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3084  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.1 
 
 
333 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659506  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2032  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.04 
 
 
386 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3619  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.15 
 
 
364 aa  133  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3763  hypothetical protein  29.39 
 
 
378 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.854395  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1558  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.58 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3133  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.09 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585078  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3284  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.53 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.970201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2480  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.09 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1572  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.6 
 
 
360 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1224  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.67 
 
 
360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0598  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0598  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.09 
 
 
367 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0193  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.86 
 
 
362 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4950  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.63 
 
 
369 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3365  hypothetical protein  30.66 
 
 
372 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283378  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2292  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.79 
 
 
357 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0085  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.94 
 
 
366 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2542  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  27.49 
 
 
363 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.28 
 
 
370 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.135169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4219  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.85 
 
 
370 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0216896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0971  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.76 
 
 
371 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000651502  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3369  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.92 
 
 
372 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0935  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.42 
 
 
370 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.84 
 
 
400 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.837811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0933  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.42 
 
 
371 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329289  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2835  putative exported solute binding protein  30.96 
 
 
360 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3084  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.64 
 
 
387 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003132  TRAP transporter solute receptor  29.68 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000514187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0921  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.56 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3566  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.56 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.123987  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1750  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 
359 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4051  twin-arginine translocation pathway signal  30.08 
 
 
373 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0832  Extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
363 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4514  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.37 
 
 
364 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4440  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.82 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.270003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02705  hypothetical protein  29.53 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3285  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.22 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4515  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.93 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2924  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.36 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3338  hypothetical protein  27.98 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0937  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.77 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.592464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1749  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2873  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 
359 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1748  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 
359 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.65 
 
 
361 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2874  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 
361 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2892  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.02 
 
 
387 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3750  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.08 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.871351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2243  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.12 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273001  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1941  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.58 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.49323  normal  0.352115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2016  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.47 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0633546  normal  0.0167782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0892  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000149436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0040  putative extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3477  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.41 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4436  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.02 
 
 
369 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2999  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.63 
 
 
379 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1404  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
358 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1416  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.9 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3120  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.34 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0172761  normal  0.942467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0129  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2164  transporter, periplasmic component  31.78 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0458836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28431  TRAP-T family tripartite transporter, substrate binding protein  26.96 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.986733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.41 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1456  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.8 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0624935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0531  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.15 
 
 
369 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.887659 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1273  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.4 
 
 
360 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0946  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.57 
 
 
374 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1216  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.42 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0446  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.36 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00272496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0671  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.06 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0345  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3466  putative periplasmic mannitol-binding protein  28.47 
 
 
363 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577251 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0428  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.61 
 
 
387 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0280038  normal  0.0226901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0883  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.62 
 
 
364 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550638  hitchhiker  0.00000307081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0957  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.94 
 
 
360 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.861985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1039  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.94 
 
 
360 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0821806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1502  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.68 
 
 
360 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2657  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.01 
 
 
335 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1241  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.39 
 
 
385 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000459944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1100  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
370 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1951  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.11 
 
 
371 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2188  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.72 
 
 
363 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0149275  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3867  hypothetical protein  28.57 
 
 
379 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0795964  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1474  twin-arginine translocation pathway signal  30.51 
 
 
362 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1554  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.57 
 
 
360 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1067  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 
377 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2244  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31 
 
 
359 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342958  normal  0.0290816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3372  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  28.33 
 
 
379 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0789991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2011  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.69 
 
 
366 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0290842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4421  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.81 
 
 
368 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3018  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.58 
 
 
379 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4720  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.86 
 
 
364 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.607383  normal  0.0697574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3467  putative periplasmic mannitol-binding protein  26.71 
 
 
362 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3328  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.95 
 
 
363 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0914439  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2049  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
362 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>