More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2894 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 521 aa  1015    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  66.52 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  57.31 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  56.37 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.67 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  59.87 
 
 		 504 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  61.25 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  57.89 
 
 		 517 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  55.97 
 
 		 520 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  61.61 
 
 		 520 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  57.28 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.53 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  55.78 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  63.1 
 
 		 522 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  61.66 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  62.41 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  61.05 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  59.58 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  58.51 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.72 
 
 		 491 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  57.78 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  60.98 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  55.49 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.78 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.85 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  60 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  60.98 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  61.73 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  59.68 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.95 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  60.04 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  57.14 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.91 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  62.15 
 
 		 527 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  61.92 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  60.75 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  62.88 
 
 		 526 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.95 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  61.72 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  58.68 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  57.23 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51.42 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  52.49 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  52.17 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  52.3 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  52.81 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  50 
 
 		 515 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.11 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  52.83 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  52.83 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  51.86 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.82 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  52.41 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  51.1 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50.65 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  47.97 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  47.97 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  51.2 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.98 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.6 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  51.09 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  51.71 
 
 		 457 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  51.54 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0648  signal recognition particle protein  53.55 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.773728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  52.35 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0201  signal recognition particle protein  51.93 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0642  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.13 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.821014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  52.03 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  50.65 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.06 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  51.27 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1150  signal recognition particle protein  52.3 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  49.13 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  51.1 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0219  signal recognition particle protein  50.76 
 
 		 460 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.382066  normal  0.73779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  51.1 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15960  signal recognition particle protein Ffh  52.4 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144741  normal  0.536445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  51.54 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>