More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1758 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  99.81 
 
 
523 aa  1015    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  82.37 
 
 
514 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  81.12 
 
 
525 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  100 
 
 
523 aa  1016    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  82.16 
 
 
527 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  64.47 
 
 
516 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  64.47 
 
 
511 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  82.75 
 
 
526 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  84.17 
 
 
522 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  94.67 
 
 
523 aa  787    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  72.9 
 
 
515 aa  677    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  64.3 
 
 
520 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  64.49 
 
 
520 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.65 
 
 
515 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  72.54 
 
 
522 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  65.14 
 
 
514 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  64.86 
 
 
517 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  64.2 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  71.03 
 
 
551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  64.75 
 
 
526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  64.78 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  70.48 
 
 
521 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  63.43 
 
 
540 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  64.62 
 
 
514 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  65.13 
 
 
516 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  64.11 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.21 
 
 
504 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.82 
 
 
491 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.74 
 
 
491 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.17 
 
 
505 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  63.87 
 
 
504 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  60.38 
 
 
505 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  59.61 
 
 
498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  55.82 
 
 
511 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.03 
 
 
514 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  61.01 
 
 
484 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  60 
 
 
457 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.53 
 
 
521 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  60.38 
 
 
501 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.99 
 
 
501 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  58.44 
 
 
461 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  52.44 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.56 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.35 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.9 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.01 
 
 
449 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.88 
 
 
458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  51.35 
 
 
515 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.12 
 
 
458 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.88 
 
 
458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  52.68 
 
 
467 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.89 
 
 
450 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  52.46 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.24 
 
 
452 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  51.64 
 
 
459 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  52.45 
 
 
453 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.57 
 
 
463 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  52.45 
 
 
453 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  52.45 
 
 
453 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  52.45 
 
 
453 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  51.61 
 
 
453 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  52.45 
 
 
453 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  52.21 
 
 
453 aa  435  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  50.79 
 
 
452 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  51.68 
 
 
457 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  50 
 
 
485 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  52.24 
 
 
512 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  51.75 
 
 
453 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  51.59 
 
 
457 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  50.56 
 
 
457 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50 
 
 
453 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  51.15 
 
 
453 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  51.38 
 
 
453 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  50.56 
 
 
478 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1080  signal recognition particle protein  49.32 
 
 
447 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  51.56 
 
 
457 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.93 
 
 
446 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  50.78 
 
 
453 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.16 
 
 
447 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  51.56 
 
 
457 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
446 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  47.41 
 
 
458 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.35 
 
 
447 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  49.89 
 
 
518 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.41 
 
 
492 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
458 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  46.98 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.18 
 
 
449 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  50.92 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  49.42 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  49.42 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50.35 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>