More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0068 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  100 
 
 		 515 aa  1011    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  74.64 
 
 		 523 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  74.64 
 
 		 523 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  72.95 
 
 		 523 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  73.54 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  75 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  75 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  72.08 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  72.05 
 
 		 526 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  62.33 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  60.58 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  60.47 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  61.54 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  61.64 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  61.62 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  61.34 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.64 
 
 		 515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  66.44 
 
 		 521 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  63.35 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  67.58 
 
 		 522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  63.62 
 
 		 517 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  66.28 
 
 		 551 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  60.29 
 
 		 504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  64.23 
 
 		 516 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  65.98 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  61.07 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.01 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.85 
 
 		 491 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  58.46 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  59.11 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  56.21 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.91 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  53.15 
 
 		 498 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  59.08 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.02 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  56.7 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.47 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  56.59 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  56.42 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.14 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.35 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.91 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.94 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.91 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  51.65 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  49.22 
 
 		 449 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  50 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.95 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  50.58 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  47.96 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  49.44 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  50.8 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.29 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  50.78 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  50.57 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  47.15 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  47.68 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  48.86 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.32 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  49.13 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  49.31 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  50.67 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  49.19 
 
 		 443 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  51.38 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.66 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>