More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2888 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  72.42 
 
 		 492 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  76.65 
 
 		 512 aa  703    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  76.24 
 
 		 512 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  100 
 
 		 518 aa  1034    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  79.95 
 
 		 508 aa  727    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  65.01 
 
 		 493 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  58.41 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  58.04 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  56.32 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  56.08 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.42 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  58.8 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  60 
 
 		 449 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  56.28 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.69 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  58.64 
 
 		 452 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  58.84 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  57.58 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  57.01 
 
 		 446 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.93 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  55.45 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  55.45 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  55.45 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  54.67 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  55.45 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  57.77 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  55.45 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  57.31 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  56.15 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  56.54 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  57.48 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  57.48 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  55.22 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  55.22 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  55.22 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  56.87 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  57.21 
 
 		 453 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  54.91 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  56.77 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  54.91 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  59.81 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  54.91 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  55.22 
 
 		 449 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.81 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  55.22 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.92 
 
 		 447 aa  475  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  55.61 
 
 		 444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  52.11 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  49.29 
 
 		 521 aa  465  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.84 
 
 		 491 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  54.39 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  54.36 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  53.22 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  53.22 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  54.13 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.32 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 433 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  50.11 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  50.11 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.58 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.53 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.93 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  53.09 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.86 
 
 		 520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  53.09 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  52.55 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.19 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  50.65 
 
 		 491 aa  448  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  49.34 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51.86 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  52.16 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  52.85 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  48.26 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.77 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.26 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  50.98 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.05 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.1 
 
 		 458 aa  445  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  52.41 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.22 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  52.47 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>