More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1707 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 511 aa  1026    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  97.48 
 
 		 515 aa  949    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  83.88 
 
 		 515 aa  842    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  64.02 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  66.14 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  67.04 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.75 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  64.32 
 
 		 457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  64.57 
 
 		 458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  65.61 
 
 		 457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  64.82 
 
 		 457 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15960  signal recognition particle protein Ffh  65.56 
 
 		 457 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144741  normal  0.536445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  65.04 
 
 		 457 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1373  signal recognition particle protein Ffh  64.9 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  65.42 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1018  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.13 
 
 		 458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  64.52 
 
 		 485 aa  561  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  63.88 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  66.12 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  66.52 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  66.52 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  64.38 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  66.52 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  64.16 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  66.06 
 
 		 457 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1066  signal recognition particle protein  65.54 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  63.94 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4158  signal recognition particle protein  65.54 
 
 		 458 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.485937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  63.94 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  62.83 
 
 		 453 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  63.94 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  63.94 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  63.94 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1461  signal recognition particle protein  65.32 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0499912  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4260  signal recognition particle protein  65.32 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  62.44 
 
 		 452 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1472  signal recognition particle protein Ffh  65.44 
 
 		 458 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1281  Signal recognition particle protein  65.44 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  64.22 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2755  signal recognition particle protein  64.54 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  66.05 
 
 		 453 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  60.93 
 
 		 451 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  65.2 
 
 		 457 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  62.39 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  65.12 
 
 		 453 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  65.12 
 
 		 453 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0648  signal recognition particle protein  66.03 
 
 		 461 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.773728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  64.88 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  65.12 
 
 		 453 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  62.64 
 
 		 452 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  67.14 
 
 		 460 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1286  signal recognition particle protein  65.61 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000571618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  64.42 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  65.84 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  65.84 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  65.84 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  59.78 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  59.78 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  61.67 
 
 		 459 aa  531  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0094  signal recognition particle protein  66.9 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000225089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  64.17 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  61.04 
 
 		 462 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  62.53 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.75 
 
 		 458 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.01 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  58.52 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  56.86 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  58.52 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03481  hypothetical protein  65.64 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002535  signal recognition particle subunit Ffh SRP54  65.56 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  56.48 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  56.96 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 455 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  56.48 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  56.48 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.04 
 
 		 455 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.48 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.39 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  57.67 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.67 
 
 		 447 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  56.26 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  55.82 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  56.04 
 
 		 455 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  55.82 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  55.88 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  55.88 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.6 
 
 		 450 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>