More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1184 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 504 aa  984    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  63.66 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.89 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  58.28 
 
 		 516 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  56.82 
 
 		 511 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  62.33 
 
 		 551 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  60.33 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  63.7 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  60.82 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  59.57 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  60.7 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  58.69 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  61.22 
 
 		 540 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.87 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  63.58 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  56.42 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  61.33 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  62.58 
 
 		 521 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  54.34 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.01 
 
 		 491 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  56.24 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  61.49 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  61.59 
 
 		 484 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  59.45 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  61.06 
 
 		 504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  62.21 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  62.21 
 
 		 523 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.06 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  57.79 
 
 		 498 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  60.83 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.08 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  61.98 
 
 		 525 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.59 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  62.21 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  61.06 
 
 		 523 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  61.06 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  61.06 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.4 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  53.18 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.69 
 
 		 521 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.5 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.9 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.44 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  52.61 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  51.85 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.59 
 
 		 448 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  49.25 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  51.23 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  49.32 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  48.36 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 449 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  49.32 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  49.1 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.35 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  48.34 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  48.34 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.58 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  48.13 
 
 		 461 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.21 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  49.01 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  46.98 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 512 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50.66 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  47.73 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  50 
 
 		 454 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>