More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2056 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  70.82 
 
 		 449 aa  634    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  100 
 
 		 446 aa  895    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  70 
 
 		 452 aa  614  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  68.69 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  69.23 
 
 		 453 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  66.74 
 
 		 448 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  66.82 
 
 		 444 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.91 
 
 		 447 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  62.78 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  64.57 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.79 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  65.32 
 
 		 448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  63.19 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  63.19 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  63.19 
 
 		 449 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  63.43 
 
 		 449 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  63.19 
 
 		 449 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  62.25 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  62.96 
 
 		 449 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.37 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  60.04 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 479 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  56.92 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.47 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  56.86 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  57.3 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  57.79 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  59.63 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  59.4 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  57.11 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  56.92 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  57.51 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  57.66 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  58.29 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  60.05 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  58.06 
 
 		 453 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  55.18 
 
 		 508 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  58.05 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  55.81 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  57.01 
 
 		 493 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  56.34 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  55.86 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  55.86 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  59.07 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  59.07 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  55.56 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  55.11 
 
 		 454 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.31 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.41 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.41 
 
 		 481 aa  482  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  57.01 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  57.01 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  55.16 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  52.28 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.99 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  54.38 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  54.26 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  52.95 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  54.38 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  53.06 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.28 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  52.05 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  53.17 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  54.73 
 
 		 524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  53.68 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.58 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  54.05 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  53.44 
 
 		 442 aa  461  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 457 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.69 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  51.98 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.89 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  52.76 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.69 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  52.91 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  53.57 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.57 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  52.69 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.75 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  53.58 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>