More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3390 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  100 
 
 		 440 aa  881    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  71.3 
 
 		 443 aa  656    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  84.28 
 
 		 439 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  67.57 
 
 		 441 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  65.23 
 
 		 450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  64.09 
 
 		 445 aa  571  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  62.95 
 
 		 446 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  62.98 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  62.59 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  60.05 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  57.69 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  56.78 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.55 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  56.09 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  56.32 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  55.17 
 
 		 449 aa  494  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  57.24 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  55.86 
 
 		 449 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.4 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.46 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.85 
 
 		 448 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.35 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.63 
 
 		 452 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.05 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  51.36 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  50.9 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.75 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.54 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.71 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53 
 
 		 445 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  51.13 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.2 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  50 
 
 		 444 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  49.06 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  48.51 
 
 		 443 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 453 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.27 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  51.99 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  49.31 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.63 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.95 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  49.19 
 
 		 528 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  47.4 
 
 		 518 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.43 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  46.73 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.84 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  49.53 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  48.97 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.25 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  48.87 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.82 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.59 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  48.61 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.2 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  48.72 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  48.94 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  46.79 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>