More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1301 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  72.39 
 
 
528 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  66.73 
 
 
516 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  67.06 
 
 
508 aa  665    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  74.32 
 
 
521 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.97 
 
 
535 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.67 
 
 
520 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  69.23 
 
 
515 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  100 
 
 
514 aa  1013    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  66.73 
 
 
535 aa  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  79.96 
 
 
519 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.67 
 
 
520 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  77.03 
 
 
524 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  75.94 
 
 
518 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  97.28 
 
 
514 aa  933    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.67 
 
 
520 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  76.59 
 
 
515 aa  676    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  68.2 
 
 
522 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  65.88 
 
 
517 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  72.16 
 
 
531 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  66.41 
 
 
522 aa  632  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  66.36 
 
 
525 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.25 
 
 
551 aa  629  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.28 
 
 
523 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.44 
 
 
527 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.42 
 
 
517 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  64.42 
 
 
536 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  69.21 
 
 
528 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  69.93 
 
 
515 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  62.16 
 
 
521 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  61.22 
 
 
532 aa  591  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.92 
 
 
604 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  65.4 
 
 
525 aa  588  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.88 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  65.83 
 
 
527 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.36 
 
 
529 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.83 
 
 
530 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  65.16 
 
 
556 aa  556  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  64.56 
 
 
544 aa  552  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.21 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  55.5 
 
 
445 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  52.44 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.37 
 
 
446 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.75 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.12 
 
 
453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  53.81 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.86 
 
 
450 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.83 
 
 
449 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53 
 
 
448 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  55.09 
 
 
444 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.93 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  52.26 
 
 
441 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.54 
 
 
452 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.58 
 
 
443 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  49.3 
 
 
479 aa  445  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.57 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.5 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.61 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.95 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.3 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.85 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.95 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.49 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.3 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.26 
 
 
449 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.91 
 
 
469 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  53.23 
 
 
451 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.33 
 
 
446 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.26 
 
 
449 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  51.27 
 
 
455 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  51.27 
 
 
455 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
458 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  51.55 
 
 
518 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.53 
 
 
452 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  50 
 
 
440 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.32 
 
 
481 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  50.92 
 
 
439 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  51.26 
 
 
453 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
453 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.37 
 
 
458 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  52.47 
 
 
512 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.29 
 
 
470 aa  431  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  50.22 
 
 
452 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  49.67 
 
 
463 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.65 
 
 
447 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  48.64 
 
 
452 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  51.47 
 
 
459 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.2 
 
 
454 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  51.72 
 
 
447 aa  428  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  50.83 
 
 
445 aa  428  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  49.89 
 
 
453 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  49.45 
 
 
478 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  53 
 
 
452 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>