More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4758 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  100 
 
 		 439 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  84.28 
 
 		 440 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  75.93 
 
 		 443 aa  682    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  69.35 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  68.59 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  66.91 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  66.82 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  64.61 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  68.27 
 
 		 442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  62.73 
 
 		 442 aa  567  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  61.87 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.08 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  58.16 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  58.39 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  58.16 
 
 		 449 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  59.54 
 
 		 451 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  57.93 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  56.78 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  55.48 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.46 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.24 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.39 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  54.34 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.37 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.94 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.86 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.42 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.9 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.66 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  53 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.05 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.85 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 448 aa  448  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  52.76 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  49.18 
 
 		 450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 433 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.94 
 
 		 447 aa  441  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.58 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 455 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.19 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 455 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  52.67 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 457 aa  438  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  51.67 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  51.67 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  51.69 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  52.04 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  51.69 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.07 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  50.45 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  51.46 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  51.53 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  50.81 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  51.53 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  51.53 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.43 
 
 		 529 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  50.23 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.64 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>