More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2996 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  100 
 
 		 454 aa  921    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  100 
 
 		 454 aa  921    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.57 
 
 		 452 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.65 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  60.28 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  59.3 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  59.3 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  59.3 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  59.3 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  60.23 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  59.21 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  58.9 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  59.87 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  60.93 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  58.84 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  60.99 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  60.32 
 
 		 445 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  59.02 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  58.56 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  61.02 
 
 		 453 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  57.14 
 
 		 508 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.91 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  58.41 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  56.83 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  57.31 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  60.56 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  57.94 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  61.31 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  56.67 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.65 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  56.94 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.21 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.21 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  57.24 
 
 		 493 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.55 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.39 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  56.88 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  55.61 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  54.41 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.52 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  55.73 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.24 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  55.5 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.7 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  54.25 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  55.73 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.31 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.76 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.95 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  53.92 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  55.05 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  55.05 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.44 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.81 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  53.42 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  55.02 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  52.97 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  53 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  54.36 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  55.3 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  53.44 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  54.92 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  52.27 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  52.98 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  53.48 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  52.67 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  53.9 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.35 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  51.56 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  53.12 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  53.41 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  53.23 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  50.12 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  54.69 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  53.41 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  53.41 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  51.62 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  53.92 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  51.62 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  53.18 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  53.41 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.39 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  53.92 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>