More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1304 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  100 
 
 		 445 aa  885    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  61.66 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  62.21 
 
 		 449 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  61.29 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  61.29 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  61.52 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  61.29 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  61.29 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.2 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  61.06 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  60.76 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  58.84 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  60.71 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  59.58 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  58.31 
 
 		 453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  59.35 
 
 		 455 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  59.42 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  59.35 
 
 		 455 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  56.7 
 
 		 449 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  60.14 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.53 
 
 		 447 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.89 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.7 
 
 		 481 aa  498  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  55.28 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  54.93 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  55.03 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  55.48 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  57.34 
 
 		 452 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  55.12 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  55.26 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  56.54 
 
 		 452 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  56.54 
 
 		 452 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  54.53 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.04 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.73 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.9 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  54.71 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  54.78 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.73 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  53.53 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  52.08 
 
 		 520 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  54.18 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  53.08 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  53.3 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  53.08 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.86 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  55 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  55 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  52.49 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.91 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  53.32 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  53.24 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.01 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  52.61 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.87 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  52.39 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.05 
 
 		 447 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.9 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.29 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  54.78 
 
 		 472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.82 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  52.76 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.44 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  53.35 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  51.02 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.2 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  438  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.44 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  52.53 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 531 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  49.56 
 
 		 517 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  54.29 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.88 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  49.2 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 522 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>