More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2081 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  64.52 
 
 		 516 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  64.72 
 
 		 508 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  80.5 
 
 		 520 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  78.97 
 
 		 522 aa  799    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  68.43 
 
 		 515 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  65.66 
 
 		 514 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  72.21 
 
 		 515 aa  713    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  76.36 
 
 		 518 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  76.08 
 
 		 525 aa  739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  74.6 
 
 		 524 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  77.61 
 
 		 535 aa  806    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  100 
 
 		 517 aa  1032    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  68.55 
 
 		 528 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  80.5 
 
 		 520 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  72.1 
 
 		 521 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  80.5 
 
 		 520 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  80.5 
 
 		 522 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  70.29 
 
 		 531 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  65.66 
 
 		 514 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.5 
 
 		 551 aa  627  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  66.19 
 
 		 536 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.61 
 
 		 535 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.24 
 
 		 527 aa  618  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.43 
 
 		 528 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  69.16 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.11 
 
 		 523 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  61.61 
 
 		 532 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  72.44 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  68.89 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  66.52 
 
 		 528 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  66.29 
 
 		 527 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  67.04 
 
 		 525 aa  589  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.47 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.67 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  65.38 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  64.79 
 
 		 544 aa  579  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  58.33 
 
 		 521 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.07 
 
 		 530 aa  558  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.2 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.36 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.91 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.47 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.92 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.75 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.03 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.24 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.68 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.55 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.8 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  50.9 
 
 		 453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  50 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  48.43 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.45 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.32 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  47.98 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.64 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  47.98 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  48.19 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  48.31 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  46.6 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.81 
 
 		 470 aa  428  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.55 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.39 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  48.84 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  48.87 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1502  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  48.42 
 
 		 518 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.32 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  47.22 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.86 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  45.27 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  48.2 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  49.24 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  46.87 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  48.75 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  48.23 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.08 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  49.33 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  46.3 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  49.42 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  50.56 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  45.05 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>