More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1611 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  69.69 
 
 		 515 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.56 
 
 		 515 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  77.63 
 
 		 535 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  79.65 
 
 		 520 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  75.52 
 
 		 518 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  64.97 
 
 		 508 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  100 
 
 		 522 aa  1027    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  78.97 
 
 		 517 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  75.57 
 
 		 525 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  72.56 
 
 		 524 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  79.65 
 
 		 520 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  79.65 
 
 		 520 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  78.67 
 
 		 522 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  68.15 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  64.98 
 
 		 516 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  71.49 
 
 		 521 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.12 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  65.83 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  65.44 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.39 
 
 		 551 aa  621  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  69.39 
 
 		 531 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.14 
 
 		 535 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  65.5 
 
 		 536 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  61.77 
 
 		 532 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.91 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.98 
 
 		 523 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  65.89 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  67.49 
 
 		 515 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.29 
 
 		 604 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  67.19 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  67.05 
 
 		 519 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.5 
 
 		 529 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.84 
 
 		 517 aa  588  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  65.17 
 
 		 528 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  65.16 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  58.33 
 
 		 521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  63.95 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.53 
 
 		 530 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.41 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.83 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.36 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.8 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.09 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.94 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.04 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 449 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.83 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  49.23 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.31 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.51 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.58 
 
 		 446 aa  445  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  49.44 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 479 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  47.83 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  48.8 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.33 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.68 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  49.21 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  44.59 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  47.23 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1502  signal recognition particle protein  53.12 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.4 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.46 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  52.07 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  49.1 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  49.25 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  48.26 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.79 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.4 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  46.19 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.74 
 
 		 512 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  49.24 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  47.56 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>