More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2489 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.04 
 
 		 527 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.81 
 
 		 604 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  67.23 
 
 		 536 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  67.86 
 
 		 521 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  67.04 
 
 		 525 aa  685    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  72.92 
 
 		 528 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  93.35 
 
 		 527 aa  945    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 529 aa  1061    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  69.61 
 
 		 532 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  65.36 
 
 		 528 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.54 
 
 		 523 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.53 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  62.17 
 
 		 508 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  68.49 
 
 		 524 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  69 
 
 		 544 aa  611  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  71.1 
 
 		 530 aa  611  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  68.62 
 
 		 556 aa  607  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  64.05 
 
 		 516 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  61.68 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  65.45 
 
 		 531 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  65.66 
 
 		 518 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  66.44 
 
 		 515 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  66 
 
 		 517 aa  591  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  63.47 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  59.74 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.58 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  59.66 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  57.84 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  65.17 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.53 
 
 		 551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  66.13 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  66.22 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  65.43 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.1 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.1 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.1 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  63.11 
 
 		 519 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.53 
 
 		 517 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  48.91 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.46 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.52 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 450 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.41 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.64 
 
 		 443 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  48.68 
 
 		 445 aa  435  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  48.98 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.25 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.72 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  49.68 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  48.29 
 
 		 521 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  49.14 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  46.81 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.68 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  48.41 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 442 aa  425  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  47.86 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  48.31 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  48.7 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  47.86 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  48.55 
 
 		 458 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 442 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  48.27 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  46.1 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  45.89 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  47.55 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  48.27 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  48.83 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.49 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  47.17 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  49.13 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.15 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  48.92 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  48.92 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  48.92 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  48.92 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  48.92 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.29 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  49.44 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  48.39 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  49.1 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  48.7 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>