More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  66.47 
 
 
527 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  66.79 
 
 
536 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.48 
 
 
535 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 
604 aa  1205    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  61.87 
 
 
532 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.6 
 
 
529 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.47 
 
 
527 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  68.74 
 
 
528 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  71.75 
 
 
528 aa  625  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  68.99 
 
 
524 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  65.9 
 
 
525 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  69.27 
 
 
521 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  66.82 
 
 
516 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  64.51 
 
 
508 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  62.72 
 
 
531 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  65.05 
 
 
518 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  65.21 
 
 
528 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  62.42 
 
 
522 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  64.68 
 
 
521 aa  588  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  66.89 
 
 
544 aa  588  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  60.56 
 
 
517 aa  588  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  63.96 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  66.29 
 
 
556 aa  581  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.8 
 
 
515 aa  582  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  62.27 
 
 
535 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.7 
 
 
523 aa  581  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.77 
 
 
530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.3 
 
 
551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  64.27 
 
 
522 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  65.6 
 
 
514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  65.15 
 
 
514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  60.74 
 
 
515 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  64.46 
 
 
519 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.68 
 
 
520 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.68 
 
 
520 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.68 
 
 
520 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  65.27 
 
 
525 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.72 
 
 
517 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.85 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.95 
 
 
443 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.34 
 
 
445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.22 
 
 
446 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  49.57 
 
 
449 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.04 
 
 
446 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  48.88 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  51.35 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  47.85 
 
 
446 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.55 
 
 
447 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.56 
 
 
447 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  50.46 
 
 
448 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.37 
 
 
481 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
492 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  45.77 
 
 
518 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.22 
 
 
450 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  46.85 
 
 
520 aa  428  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  47.22 
 
 
445 aa  425  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.6 
 
 
449 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.86 
 
 
452 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  47.76 
 
 
448 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  46.65 
 
 
455 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  46.85 
 
 
521 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  47.99 
 
 
449 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  47.54 
 
 
449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  47.78 
 
 
449 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  47.54 
 
 
449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  47.1 
 
 
443 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  47.67 
 
 
450 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  48.32 
 
 
439 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  48.22 
 
 
444 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.1 
 
 
443 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  47.83 
 
 
442 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  47.77 
 
 
449 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.78 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  48.98 
 
 
469 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  48.64 
 
 
459 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  48.12 
 
 
463 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  46.21 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  46.21 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.33 
 
 
470 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  48.44 
 
 
459 aa  414  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  47.32 
 
 
451 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.84 
 
 
512 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  47.17 
 
 
449 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  47.9 
 
 
453 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.01 
 
 
479 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  47.65 
 
 
452 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  46.98 
 
 
447 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  47.02 
 
 
441 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
512 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  46.8 
 
 
450 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.82 
 
 
454 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  46.91 
 
 
518 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  46.76 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.24 
 
 
444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>