More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0967 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  100 
 
 		 443 aa  890    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  66.29 
 
 		 446 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.91 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  64.11 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  64.34 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  62.65 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.37 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  60.36 
 
 		 449 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  59.14 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  59.5 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  60.59 
 
 		 446 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  62.25 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.61 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  60.37 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  57.05 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  57.05 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  57.05 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  57.05 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  56.82 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  60.28 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  58.11 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  57.11 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  58.56 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  56.41 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  56.18 
 
 		 455 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  60.13 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  60.13 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  55.98 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  55.1 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  56.98 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  55.66 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.75 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  55.23 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  54.67 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  54.95 
 
 		 452 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  55.07 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  58.33 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  54.92 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  55.03 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  56.28 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  53.99 
 
 		 512 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.66 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.47 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.12 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.44 
 
 		 512 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  53.15 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  55.48 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  55.48 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  53.38 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  52.14 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  55.35 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  55.01 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  55.58 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  53.43 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  54.18 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.19 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.58 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  53.58 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  53.27 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  53.35 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.33 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  53.38 
 
 		 476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.31 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  52.55 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  52.79 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 441 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  51.95 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.92 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  51.41 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  50 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.34 
 
 		 515 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  51.27 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.34 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  51.95 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  51.62 
 
 		 515 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  48.71 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  49.45 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  53.08 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>